gtf2a1 Summary [species: Xenopus laevis and Xenopus tropicalis]

Summary

Expression

XB-GENEPAGE-1006403

[provisional- machine annotated only]

Gene Symbol: gtf2a1 [Predicted: Source is Human Entrez Gene]

Gene Name: general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa [Predicted: Source is Human Entrez Gene]

Synonyms: tf2a1, tfiia, tfiiaa/b Add Xenopus synonyms

Gene Function: RNA polymerase II transcription initiation factor TFIIA, large chain

Interactants: tbp(5) , gtf3a(3) , gtf2a1l(2) , bdp1(1) , crebbp(1) , gtf2b(1) , gtf3c1(1) View All

XB-GENE-1006404

XB-GENE-6255453

XB-GENE-1006409

Molecules	tropicalis	laevis a	laevis b
Gene	JGI XT Genome 7.1 JGI XT Genome 4.1 Ensembl 4.1	JGI XL Genome 6.0
	Entrez Gene	Entrez Gene	Entrez Gene
mRNA	Refseq >NM_001016908\|Xenopus (Silurana) tropicalis general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa (gtf2a1), mRNA CCTCCTGTGTGTGGGGTATTTAGGCTAGGGCCACCCTCCCTTAATTCCTGTTGGAAATGGCGGCCTCGGCTAACGCAAACCCCGTGCCTAAATTGTACAGATCTGTGATTGAAGATGTTATCAATGATGTAAGGGAACTTTTTCTGGATGAGGGAGTTGATGAGCAAGTCTTAATGGAGCTGAAAACACTTTGGGAAAGCAAGCTGATGCAGTCTAAAGCAGTTGATGGTTTTCACTCTGAGGAACAGCAACTTCTACTGCAGGCTCAACAACAGCAACATCCTCAGCATCATCATGTATCGCAGCACCCTCAGCAGCAACAGGCAGCATCTCACCAGACACAGACTCAGCAGGTTCTCATCCCCGCCACACACCAAGCTCCCCAGCAGCAAGTCCTTGTACAAGATTCTAAGTTGATTCAGCATATGACAACACAAGGAATGAGTGCTGCAGCTACAGCCGCCACCCTGGCACTTCCTGCTGGTGTTACACCAGTTCAGCAGCTGATCACAAACTCTGGCCAACTATTGCAGGTGGTAAGGGCAGCAAATGGTGCTCAGTATCTTATCCAGCCTCAGCAGTCCATGGTGTTGCAGCAGCAAGTAATTCCACAGATGCAGCCAGGTGGAGTTCAAGCTCCTGTTATTCAACAGGTGTTAGCTCCGATTCCAGGAGGCCTCTCCCAACAGACCGGAGTCATTATACAGCCACAACAGATCTTGTTTACAGGAAACAAGACTCAAGTTATACCCACTACTATGTCTGCTCCTCAAGCACCAACACAGGGACAGCTTACTGTGACAAGTCAGCAGCAGCAACAAGGTCAGCAGCAGCAGGTTGTCCTGCAGGTTGATGGTGCTGGGGACACATCCTCTGAGGAGGATGAAGATGAGGATGAAGACTATGATGATGAGGAAGAGGAGGACAAGGAGAAAGATGGAGAAGATGGTCAAGTGGAAGAGGAACCACTCAACAGTGAAGATGATGTAAGCGATGAGGAAGGGCAGGAGCTCTTTGATACAGAGAATGTTGTAGTTTGCCAGTATGATAAGATCCACAGAAGTAAAAACAAATGGAAATTTCATCTTAAAGATGGCATCATGAACCTGAATGGGCGAGATTTTGTCTTCTCCAAAGCCATTGGGGATGCAGAATGGTGAAGATGCACCAGCTTTTGATAAATCAAATGAAAGAGCTTTAGGGGATTTTCTGGATGAACGCAAGGGGATAGACCTAAATTATGCAGATTGCCTCCTTTTATTCATCCCAGGGCCTGACTGGAGCAAAATGTCCAGTTCCCCAGTGGAGCATCAGAGGGAAATGTGGATCATATTGCCAACTTAAAGGATGTGTTAAATCACCCAAGATGGCTTGGTAGGGGCAATATGAACTTGGCACTGACTATAGTGGACAAAGCTGCCAATTCCAGCAATGGCTTTAGTGTGTAACTTGCTCACTTAAACCTCTGCAGACTTCAATCTCCTTTGCTACGCAAATTCAGCAGGCATTGAGCAGCCATACTCTACAGCTATACTAACATCTGCTCGGAGTACACAGTTGCTATATTTTAATAGTGCTGTTGAGTTTATTCTGGACAAACTTACCATGTCTCCTGGTTAATTTTTGGCCATTCTTAGAACCACTTCCCTTTCAATGACAGTATATTAAGCTTCAGTCTTAGTGTTTAGCACTGATGATCCCAAAATCCTCCATTTTTTTTTTTCAACTGTTCAACATTAAGGTCTTTAAATACATTTGTCTAAGACATACCCTTCAGTTCATTGGATATGCATTGAGTGGGCAGGTATATTCCATAACAGGCAGTGTTCTTACACTGCTGTAATGATTAAGTGCAAGGTGGAACATCCATTAAGATTGGTCCCATATCTGCTTACCATATAATGTGCCGTTTTTAGTTTCCATTGTAGTCAAAATGGCAGTGCCTCTTGATGCCTGTTTAGCTTTGACTACTTGAATTAGGTACTGCCTGTGCTTTAATGAATCCTCAACTGGCTTGTTTTCTAGCTTAATTTGCCACAATGAGTATTGCCTCATTTACCTGTTATACAAAAATTGCTTCCTATTTATGTTTAAGTTGAAATGGATCAAGACACCTAAATGTAAATTAATTTGTGTTCTTTGTGGTTAATGCACTGCTGGCACTTGTTGGGACACTTGGCTGTAAAGGCCCTTCTATAAGATTTTTACACAGAAGTGGCTGCATATATCTGTAGTGCATTGCAACCTTACAAAATTTAATAACACCATTAAAATTAACAGGAATGACTTTAAGAATGGTTTAAATCAAGAATTGCTCAAACTGCCTTGTAATTAGTGCCTAAATCCATACAAACTTTGCATTTGAACTAGCTCTAAATAACCCTCTGGTTACCATAAATCAGTTGTATGGTTACTTTAGCAATCCTGCAGTGGAAATGCACCTTCATTCTATGGGTGATGTCTGGTTCTGTCATTATGGTGGTTATATGTAGCTTGATTAGGAGGCAGTTAAAGGGTTTGTACAACAAAACAACTGGCCTGCAAAATGGGACCAAAGGTGCATCTGTTAATGTGCCTTAAACTGAGACTGGATACCTTTTTATTCTGTAGGAACTGTGCTCCCAGAATCCCTTGCACAGTGAGCAATATCCTACTGGTCTATCTTGCAGCTCAGACTTTGCCGTAATGACGCCCAAAGACTTTCCATGTTAACTTGTACCTGTGTTTTGGGAGAAAGAATGGAGCAGCTTTAAGTTTGCTAAGTGTGAACGACTGTACGTAGTGCTGCTCCTGTGTGAATCAGGGTGTTCCTAGATTTGGGTTTTATATTGGTCTATGGGAACTCTTGCGCTACTGTTAACTGCTGTTGTACATACAGTTGTATGGAAGGGCGGACAAATCTATTTATTATGTTTGTAAAATTCTGTAAAATTGCAGATAAAGTTTGCTTTTTTGTCTTAATGAATATTATGTTTTTAAATGCCATGCTTAGGATTGGGTTAGAAACTGTTGATCTATTTTAAGTTTTAATATTTTACCTTTGCAAAAAACTTTAATTAAAGTTATTTTAAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	Refseq >NM_001089284\|Xenopus laevis general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa (gtf2a1-a), mRNA GACGCGTGGGCTGATAGCCGTGTCTTCGCAGCTCGATCTCTCGGTATATAAAGGAGAGCGGCGACTGAGAGCAGACGGCTGGCGGCGGCGGCCCCATCCCAGCAACACCGGAGCCCGCTTGTACTCCAGGAAGCTGCCGTCTAATGCCATATCCACCTTTCCCAGAAATCCCACTAGTTGTTTCCCAGAAATCCCACTAGTTGCCCCCTCTCTAACAGCCCCTGCGGGAGTACAGTTTTTAAGTCTTTCTAATCCCCTTCTGACTAGCCTTGTTGCTTGATTTTATTAGCTAATTGATAGTAGCCCACAATAAAGCGGGGAACTATTTTATCCCTCCGCGGAAGGGATTTTCTATTTAAGATGTAATACGGTTTTATCGTTCCCCAGACCCTGTAACCCAGGCTTTTATTAACCTTTTAATCCCAGGAGCAAATCACTGATAGATTTAACACGAGGAGAGTCTTATCTGTGTGGGGCACCCTCTCCCCTTTCATTTAACAGCCACTAAATAGTCTCACTCGGGTCAGACAGGGTGTGGGGGCAGTAGAGGGCCGGTAGCTNCCAGTGTGTGGGGTATTTAGGTTTAGGGTCTTCTTCCCCTAATTTCTGTTGGAAATGGCTAGCGCGGCCTCGGCTAACGCAAACCCCGTGCCTAAATTGTACAGATCTGTGATTGGAGATGTTATCAATGATGTGAGGGAGATTTTTCTGGATGAGGGAGTTGGTGAACAAGTCTTGATGGAGCTGAAAACGCTGTGGGAAAGCAAGCTGATGCAATCTAAAGCAGTGGATGGTTTTCACACTGAGGAACAGCAACTTTTACTGCAGGCTCAACAACAACAACAGCAGCAGCAGCAACATTCTCAGCATCACCGTGTACAACAGCACCCTCAGCAGCAGCAGGCAGCATCTCACCAGACACAACAGGTTCTCATCCCCGCTACACACCAGGCTCAACAGCAGCAAGTACTTGTACAAGAGTCCAAGATGATTCATCACATGACCCCTCAGGGAATGAGTGCTGCTACTACCCTGGCACTGCCTGCAGGTGTCACACCAGTTCAACAGCTGATCACAAACTCTGGACAACTATTACAGGTGGTCAGGGCAGCAAATGGTGCTCAGTACCTTATCCAGCCTCAGCAGTCGATGGTGCTGCAGCAGCAAGTAATTCCTCAGATGCAGCAAGGTGGTGTGCAAGCCCCTGTTATTCAACAGGTGTTAACTCCAATGCCGGGAGGTCTCTCTCAACAGACTGGTGTCATCATACAGCCGCAACAGATCTTGTTTACAGGTAACAAGACTCAAGTTATACCCAATACCATGTCTGCTCCTCAAGCACCAATACAGGGACAGCTTACTGTGACAAGTCAGCAGCAGCAACAAGGGCAGCAGCAGGCTCCACTCGTCCTGCAAGTTGATGGTGCTGGGGACACATCCTCTGAGGAGGATGAAGATGAGGATGAAGACTATGATGATGAGGAGGAAGAGGACAAGGAGAAAGATGGAGAAGATGGTCAAGTGGAAGAGGAACCACTCAACAGTGAAGATGATGTAAGCGATGAGGAAGGGCAGGAGCTCTTTGACACAGAGAATGTTGTAGTTTGCCAGTATGACAAGATCCACAGAAGTAAAAACAAGTGGAAATTTCATCTCAAAGATGGCATCATGAACCTGAATGGGAGAGATTTTGTCTTCTCCAAAGCCATTGGGGATGCAGAATGGTGAAGATACACCAGCTTTTGATAAATCAAATGGAAGAGCTTTAGGGTTTTTTTGTTTTTGATGAATGCAAGGGGATATACCTAAATTATGCAGATTGCCTCCTTTTATCCATCCCAGGGCCTGTCTGAAGCAAAGGTGTCCAATTGCCCAATGGCTCATCAGTCGGAATTTACCAACTTTAAAGGATTTGTTAAATCACCTAAGATGGCTTTAAAGGGGCAATAGTAACTTGGCACTGGCTATAGTGGACAACGCCTCCAATTGCAGCAACGACTTTGTGTAACTTGCTCACTTAAACCTCTGCAGACTTCAATCTCCTTTGCTACGCAAATCCAGCAGGCATTGAGCAGCCATACTGCTACATCTATATTAACTTCTGCTCTGAATACACAGTTGCTATATTTTAATAGTGCTGTTGAGCTTATTCTGGACACATTTACATGTCTCCTGGTTAATTTTGGCCATTCTTAGAACCACTTCCCTTTCAGTGACAGTGTATTGAGCTTCAGTCTTCACTGATGATCCCAAAGTCCTCCATTTTGTTGTATTGTTTTTTACTGTTCAGCATTAGGGCTTTCAAATTTGTCTTAAGACCTTCAGTTCACTGGACTCAATGCATTGAGTGGGCAGGTATTCCATAATAGGCAGTGTTCTCACATTACTGTAATGATTTATTGGAGGATGGAAGATCAGTCCCATATTGGCTAAGCACATAATGTGCAGTGCCGGTTTAGTTCAACTACTTCAGTTGGTTGCTGCCTGTGCTTCAGTGAATCCTCGACTAACTTGATTTCCAGCCTAATTTGCCATGAGTCTTGCTTCATTCACCTGTTAAAATTTGCATCCTTTTCTGTTTAAGATGAAATGGATCAAGACGTTATATAAATTTGCTCTTGTTCTATGTGGTTGATGCACTGCTGGCACTTGGCAGGACACTTTGCTGTAAAGGCCATTTTATTTGATACAGAAGGGACTGCCCAATTCTGTATTGCATTGCAATCTTACAAAATTGATATCCCCCATTAAATAAAATTACCAGAAATGAGTCTTAGAATGGTTTAAATGAAGTAAAGCATTGCTCAAAAACTGCCTTGTGATTGGTGCCTAAATTCATTGCAACCTTTGCATTTGAAACTAGCTCTAAATAACCATCAATCTGTTCAAGGTTTACTATATCGATCCTGCAGTGGAAATGCGCCTTCATTCTGAGGGTAATGTCTGGTTCTGGCATCATGGCGGTTGCTCGTTTAAATTGCTTGATTAGGAGGTGGTTCAATTGTTTGTAGAACAAAACTGGCCTGCAAAATGGGACCAAAGGTGCATCTGTTAATGTGCCTTAAACTGAGACTGGATACCTTGTTAATGCTGTAGGATCTGTGCTCCCAGAATCCCTTGCACAGTGAGCAATTTTCTACTGGTCTATCTTGCAGCTCAGACTTTGCCGTAATGACGCCCAAAGACTTTTCCCATGTTAATATGTACCTGTGTCTTGGGAGACAGAATGGAGCAGCTTTAAAGAAGAATTATCATGAACATTTTAGCATGCTGAAATAAAGAAACTTTCTAAATACAATAAATTAAAAATTCATTACAGTTTTTGAAATAATCGGGTTAAATTTCACTATCCCTCTCTCCGCATCCGTTTCTCTTCGTTCTGTCTTCATGCAGCAGTTGGGTGTCAGATATTCATTGACCATTTCATCCAATATATCTTATAGGGGGGCTCCTTTTGCCTAGAAGTATTAGAACCCACTCTATTAATATCACCAGAAATCCTGTCTCTCTACATGCAAATTTGTGCAAAAGGCAGTTATTTTGTTTGATCTAGAATCAGTTATTTGAGTGAGCCTGAATTCCATCTGCTAGGAAAGGGAGCCCCCCCCCCCCCCTATAAGATATATTGGATCATTCATCTGCCACCCAGCTGCTGCATGGAGACAGAGTGAAGAGAAACGGATACTGATAGTGAAGATAAACTTGATTATATCAAACTATGGCGATTTTTTTTTTCTAAGTGATTGTATTTACAAAGTTTCGTATTTCAGTATGCTGGATCTTCTATTAAATTTTCATTTTCGCGATAGTTACCCGTTTAAGTGCGACTAAGAAGTGCTGCTCCTGTGTGAATCGGGGTGTTCCTAGATTTGGGTTTTCTATTGGTCTGCGGGAACTCTTGCGCTACTGTTAACTGCTGTTGTACATACAGTTGTATGGAAGGGGCGGACAAATCTATTTATTATGTTTGTAAAATTCTGTAAAATTTGCAGATAAAGTTTTTTGTTTTTTGTCTTAACGAATGTTTTTAAATGCCATGCTTAGGATTCGATTAGAAAACTGTTGATCTATTTTAAGTTTTAATATTTTACCTTTGCAAAAAAACTTTAATTAAAGTTATTTTAAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	Refseq >NM_001090485\|Xenopus laevis general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa (gtf2a1-b), mRNA GCTAGGGACACCCTCTCCCTAATTCCTGTTGGAAATGGCGGCCTCGGCTAACGCAAACCCCGTGCCTAAATTGTATAGATCTGTGATTGAAGATGTTATCAATGATGTGAGGGAGCTTTTTCTGGATGAGGGAGTTGATGAGCAAGTCTTGATGGAGTTGAAAACACTGTGGGAAAGCAAGCTGATGCAATCTAAAGCAGTTGATGGGTTTCACTCTGAGGAACAGCAACTTCTGCTGCAGGCTCAACAACAGCAGCAGCATGCTCAGCATCACCATGTACAACAGCACCCTCAGCAACAGCAGGCAGCATCTCACCAGACACAGCAGGTTCTCATCCCTGCCACACACCAAGCTCCTCAGCAGCAAGTACTTGTACAAGAGTCCAAGCTGATACAGCATATGACCCCACAAGGAATGAGTGCTGCGGCTACAGCTGCCACCCTGGCACTGCCTGCTGGTGTTACACCGGTTCAGCAGCTGATCACTAACTCTGGCCAACTATTGCAGGTGGTCAGGGCAGCAAATGGTGCTCAGTACCTTATCCAGCCTCAGCAGTCCATGGTGTTGCAGCAACAAGTAATTCCTCAAATGCAGCCAGGTGGCGTGCAAGCTCCTGTTATTCAACAGGTGTTGGCTCCGATACCGGGAGGCCTCTCCCAACAGACTGGTGTCATTATACAGCCACAACAGATCTTATTTACTGGCAACAAGACTCAAGTCATACCCACTACTATGTCTGCTCCTCAAGCACCAACACAGGGACAACTTACAGTGACAAGTCAGCAGCAGCAACAAGGGCAGCAGCAGACTTCGATTGTCCTTCAAGTTGATGGTGCTGGGGACACATCATCTGAGGAGGATGAAGATGAGGATGAAGACTATGATGATGAGGAGGAAGAGGACAAGGAGAAAGATGGAGAAGATGGTCAAGTGGAAGAGGAACCGCTCAACAGTGAAGATGATGTAAGCGATGAGGAAGGGCAGGAGCTCTTTGACACAGAGAATGTTGTAGTTTGCCAGTATGACAAGATCCACAGAAGTAAAAACAAGTGGAAATTCCATCTCAAAGATGGCATCATGAACCTGAATGGGAGAGATTTTGTCTTCTCCAAAGCCATTGGGGATGCAGAATGGTGAAGACGCACCAGCTTTTGATAAATCAAATGGAAGTGTTTTTTTATTTTTTAAGAATGCAAGGGGATAGACCTAAATCATGCAGATTGCCTCCTTTTATCCATGCCAGGGCCTGAATGGAGCAAAGTGTCCTCAATGGAGCATCAGATGGAAATGTGGATCATATTGCCAACTTTAAAGGATGTGTTAAATCACCTATAATGGCTTGGAAGAGGCAATAGTACCTTGGCACAGACTATAGTGGGCAGAGCAGCAATGGCTTTAGTGTGTAACTTGCTCACTTAAACCTCTGCAGACTTCAATCTCCTTTGCTACGCAAATCCAGCAGGTGTTTGACAGCCATACTGCTACATCTATACTAACATCTGCTCTGAGTACACAGTTGCTATATTTTAATAGTGCTTTTGAGCTTGTTCTGGACAAACTGACACGTCTCTAAGAATTTTGCCAATTCTTAGAACCACTTCCCTTTCAGTTGACAGTATATTGACAGTCTTGGTGTTCAGCACTGAAGATTCCAAAATCCTCCATTTTGTTTTATTGTTTTAAACTGTTCGGCATTAAGGCTTTCAAATAACTTATGTCTAAGACTTACCCTTTAGTTCACTGGATATGCATTGAGCGGGCAGGTATTATTCCATAACAGGTAGGGTTTTCACATTGCTGTGATGATTTAGTCCAAGATGGAACATCTGCAAGTGAACATCAGTCCTGAAGTATATAATGTGCAGTTTTTATTTTTCCATGTGTAGTCAAAAGTGGCAGCGCAAGTTGATGCCTGTTTAGTTTGACTACTTGAATTGGGTGCTGCCTGTGCTTCAATGAATCCTTGTCTGGCTTGTTGTCCAACTTAATTTGCCACAATGAGTCTTGCTTCATTCACATGTTAATATTCCTTTTTATGTTTAAGTTGGAACTGGATTGAGACAACAAAATATACATTAAAGGGCAGATTTTTAAGGGTCGAATTGGAAATTCAATTTTTTTTTTGGTCATGAATCTCAAATTTGAATTGTGAATTATCCAAACTCCATTAAAATTTTAATTCAGATTCGAATTTCGAGATTTATCAAACCTATACCCTGGCAATATCTTGAATTTGATGATTTGCCACCTTAAACCTGACAAGTTCATGTATAAGTCAGTGGGAGAGGTCCAGTGACCAATTTGAATTATTGGCCTTCCTGACATTCAAGTTTTTTCTGAGAAAAAAACTTGATTAGAGTTAATTTTAAATGGTTTGAGCTTTTGGGTTGGTAATATTTGTTCAAACTTTTTTCTTACCCTCCCAATTGAATTTCATGTATATTCGGGGGAAAAAAAAATGCACAAATTAAATTTGTGGTTGATGCACTGCTGGTACTTGTTAGGACACTTGGCTGCAAAGGCTCTTTGATTAATACAGAAGGGGCTGTTTAGTTCTGTAGTGCATTGCCACCCTACAAAATTGATATTGCCATTAAAAAATATTAGCAAGAACGGGTTTTCAAATGGTTTAAGTCAAGTGAATCATTTCTCAAAAACTGCCTTGTAATTAGTGCCTAAATCCATGCAAACTTTGCATTCAAAACCAACTCTAAATAACCCTTTGGTTACCATTGATCAGTTTAAGGGTTACTTTAGCAATCCTGCAGTGGAAATGCACCTTCATTCTGTGGGAGTTGTCATGGTGGTTGCTCGTCTAAATTGCTTGATTAGGAGACAGTTCAAGGGTTTGTAGAACAAAACTGGCCTGCAAAATGGGACCAAAGGTGCATCTGTTCATGTGCCTTAAACTGAGACTGGATACCTTGTTAATTCTGTAGGAACGGTGCTCCCAGAATCCCATGCACAGTGAGCAATTTCCTACTGGTCTATCTTGCCGCTCAGACTTTGCCGTAATGACGCCCAAAGACTTTCCATGTTAACTCATACCTGTGTCTTGGGAGAAAGAACGGAGCAGCTTTAAAGTTTTGCGACTGTATGGCTGCTCCTGTGTGAATCGGGGTGTTCCTAAGTTTGGGTTTTATAATGGTCTGCGAGAACTCTTTGCGCTACTGTTAACTGCTGTTGTACATACAGTTGTATGGAACGGCAGACAAATCTATTTATTATGTTTGTAAAATTGCAGATAACGTTTTCTTTTTGTCTTAACGAATATGTTTTTAAATGCCATGCTTAGGATTGGATTAGAAACTGTTGATCTATTTTAAGTTTTAATATTTTACCTTTGCAAAAAACGTTAATTAAAGTTATTTTGAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Protein	Refseq >NP_001016908\|general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa [Xenopus (Silurana) tropicalis] MAASANANPVPKLYRSVIEDVINDVRELFLDEGVDEQVLMELKTLWESKLMQSKAVDGFHSEEQQLLLQAQQQQHPQHHHVSQHPQQQQAASHQTQTQQVLIPATHQAPQQQVLVQDSKLIQHMTTQGMSAAATAATLALPAGVTPVQQLITNSGQLLQVVRAANGAQYLIQPQQSMVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPIPGGLSQQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTMSAPQAPTQGQLTVTSQQQQQGQQQQVVLQVDGAGDTSSEEDEDEDEDYDDEEEEDKEKDGEDGQVEEEPLNSEDDVSDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDFVFSKAIGDAEW	Refseq >NP_001082753\|general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa [Xenopus laevis] MASAASANANPVPKLYRSVIGDVINDVREIFLDEGVGEQVLMELKTLWESKLMQSKAVDGFHTEEQQLLLQAQQQQQQQQQHSQHHRVQQHPQQQQAASHQTQQVLIPATHQAQQQQVLVQESKMIHHMTPQGMSAATTLALPAGVTPVQQLITNSGQLLQVVRAANGAQYLIQPQQSMVLQQQVIPQMQQGGVQAPVIQQVLTPMPGGLSQQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPNTMSAPQAPIQGQLTVTSQQQQQGQQQAPLVLQVDGAGDTSSEEDEDEDEDYDDEEEEDKEKDGEDGQVEEEPLNSEDDVSDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDFVFSKAIGDAEW	Refseq >NP_001083954\|general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa [Xenopus laevis] MAASANANPVPKLYRSVIEDVINDVRELFLDEGVDEQVLMELKTLWESKLMQSKAVDGFHSEEQQLLLQAQQQQQHAQHHHVQQHPQQQQAASHQTQQVLIPATHQAPQQQVLVQESKLIQHMTPQGMSAAATAATLALPAGVTPVQQLITNSGQLLQVVRAANGAQYLIQPQQSMVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPIPGGLSQQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTMSAPQAPTQGQLTVTSQQQQQGQQQTSIVLQVDGAGDTSSEEDEDEDEDYDDEEEEDKEKDGEDGQVEEEPLNSEDDVSDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNLNGRDFVFSKAIGDAEW

Genomic	tropicalis
Genome Browser	Xenbase	Xenbase JGI Ensembl UCSC	Xenbase

Synteny	Metazome

Expression	tropicalis	laevis a	laevis b
UniGene	Str.5955	Xl.28611	Xl.29248
Unigene EST Profile	EST Profile	EST Profile	EST Profile
GEO data		GEO	GEO
Images	0 expression image(s) for tropicalis and laevis

Orthology	MOD	Entrez Gene	Genetic Phenotypes	Morphants
human	OMIM:Gene, HGNC	GTF2A1
mouse	MGI	Gtf2a1	All(5) Targeted, other(5)
zebrafish	ZFIN	gtf2a1	1 Lines(s)

Publications
First:		Pathways of nucleoprotein assembly on 5S RNA genes in a Xenopus oocyte S-150 extract. [Nucleic Acids Res 1989]
Most recent:		Developmental and cell type-specific regulation of core promoter transcription factors in germ cells of frogs and mice. [Gene Expr Patterns 2006]
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Functional Ontologies
GO: Molecular:		ATP-dependent DNA helicase activity ATP-dependent RNA helicase activity ATP-dependent helicase activity More[+] ATPase activity ATPase activity, coupled ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances ATPase activity, uncoupled DNA translocase activity DNA-dependent ATPase activity RNA-dependent ATPase activity protein-transmembrane transporting ATPase activity single-stranded DNA-dependent ATP-dependent DNA helicase activity transcription initiation factor activity
Biological:		transcription initiation from RNA polymerase II promoter
Cellular Component:		nucleus
EC:		adenosinetriphosphatase
KOG:		[K] RNA polymerase II transcription initiation factor TFIIA, large chain

Reagents	tropicalis	laevis a	laevis b
Clones	open biosystems	open biosystems	open biosystems
	geneservice/RZPD imagenes	geneservice/RZPD imagenes	geneservice/RZPD imagenes
Affymetrix 1.0	Str.5955.1.S1_at [+] Str.5955.1.S2_at	Xl.21425.1.A1_at
Affymetrix 2.0		Xl2.28611.1.S2_x_at	Xl2.29248.1.S1_at

Symbol legend[+]